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火影忍者ol新忍者:標記基因全長測序

火影忍者剧场版忍者之路 www.vjqvb.icu 以PacBio公司的RS II和最新的Sequel測序系統為代表的第三代測序技術,通過SMRT單分子實時測序技術(Single molecule real-time sequencing),可以對DNA序列實現單分子級別的超長讀長測序,因而能夠輕易讀取微生物的rRNA基因/ITS全長序列,不再受制于短序列的局限性,更全面的揭示物種多樣性;其次,通過PacBio所獨有的環形一致性測序模式(Circular-consensus sequence,CCS),可以極大地提高單堿基測序的準確率,遠超二代測序的準確率,從而充分保障獲得的rRNA基因/ITS全長序列的精確性?;諞隕狹降?,PacBio的SMRT測序技術能夠大大提高我們在種甚至菌株等精細水平解析菌群多樣性和組成譜的能力。


產品特點

CCS測序模式基本原理

16S rRNA基因各V區的序列保守性并不一致,因而基于16S rRNA基因全長序列的三代測序,可以更全面地反映物種的種屬信息。a圖,以Salmonella屬為代表,全長序列的種間差異達到97.4%,但V4區高度保守,二代測序結果將低估該物種的多樣性;b圖,某些物種在V4區的多樣性可能高于其他V區,因而二代測序結果將高估相關物種的多樣性。*

兩種平臺測序結果的精細比較,三代測序的結果顯著降低了物種分類信息的不確定性。*

PacBio和Illumina平臺對菌群16S rRNA基因測序結果的比較,三代測序的結果能顯著提升種水平的物種檢測精確性,并大幅改善物種分類信息的不確定性。

*Singer, E., Bushnell, B., Coleman-Derr, D., Bowman, B., Bowers, R.M., Levy, A., Gies, E.A., Cheng, J.-F., Copeland, A., Klenk, H.-P., et al. (2016). High-resolution phylogenetic microbial community profiling. ISME J 10, 2020-2032.



單分子測序,全方位研究

種水平的精細組成圖


結合聚類分析的種水平菌群組成熱圖


組間差異顯著的種水平分類單元的豐度分布小提琴圖


2016年,派森諾生物在原有的PacBio RS II三代高通量測序儀基礎上,率先部署最新款Sequel測序儀,并已投入使用,獨家提供16S rRNA基因全長和ITS全長測序分析服務,助力微生物組研究!