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火影忍者纲手:全基因組甲基化測序

火影忍者剧场版忍者之路 www.vjqvb.icu DNA 甲基化對生命活動非常重要,是基因調控的手段之一 ( 即通過對位于啟動子及第一外顯子區的 CpG 島的甲基化而抑制基因的表達 ),它在基因表達調控、腫瘤研究、染色質重塑、遺傳印記、疾病研究、胚胎發育、環境與表觀遺傳和表觀異質性等方面起至關重要的作用,是表觀遺傳學研究的熱點。



方案設計


全基因組甲基化實驗設計思路為差異比較,常見的類型為實驗組與對照組 (case VS control),進行兩兩比較。通過重亞硫酸鹽對基因組 DNA 進行處理,將未甲基化的 C 堿基轉化為 U 堿基,而甲基化的 C 則不會改變,進行 PCR擴增后 U 堿基會變成 T,與原本具有甲基化修飾的 C 堿基區分開來。 WGBS 精密度高,可以精確得到單個堿基,獲得單堿基精度生物甲基化圖譜。建議設置 3-6 個生物學重復,以減少組內誤差并增強結果的可靠性。