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科研服務

火影忍者剧场版炎之中忍试验!鸣人vs木叶丸!:動植物基因組de novo測序

火影忍者剧场版忍者之路 www.vjqvb.icu 基因組從頭測序(de novo sequencing),主要針對基因組序列未知或參考基因組組裝不理想的物種,構建不同類型的基因組DNA文庫,并進行序列測定。然后使用生物信息學方法對序列進行拼接、組裝和注釋,從而繪制該物種完整的基因組序列信息。簡單基因組:重復序列低于50%,且二倍體雜合度低于0.5%的物種。


復雜基因組:重復序列高于50%,或二倍體雜合度高于0.5%,或其他多倍體物種。


產品參數


測序方案

測序策略

交付指標

項目周期

簡單基因組

純三代

文庫:20Kb 三代(80X)+10XGenomics/Bionano/ Hi-C

Contig N50≥ 1Mb

4-6個月

3+2混合拼接

三代(40X)+二代(PE,   100X)

Contig N50≥ 500Kb

復雜基因組

純三代

文庫:20Kb 三代(100X)+10XGenomics/Bionano/ Hi-C

視物種而定

6-12個月

3+2混合拼接

三代(40X)+二代(PE,   100X)

Contig N50≥ 200Kb

哺乳動物和鳥類

純三代

文庫:20Kb 三代(80X)

Contig N50≥ 3Mb

3個月

3+2混合拼接

三代(40X)+二代(PE,   100X)

Contig N50≥ 1Mb